Dessutom är affärsverket Finnpilot och de statliga bolagen Finavia Abp och MeriTaito Ab verksamma inom förvaltningsområdet.
Ämbetsverken, instituten och bolagen som lyder under ministeriet är självständiga organisationer.
Trafikverket inledde sin verksamhet i början av 2010. Trafikverket bildades av Sjöfartsverkets farledsfunktioner, Banförvaltningscentralen och Vägförvaltningens centralförvaltning.
